METODE FARMAKOLOGI 5
Senyawa yang memiliki bioaktivitas antivirus yaitu flavonoid dimana yaitu pada tanaman meniran. Meniran telah dilaporkan memiliki aktivitas sebagai antivirus bagi HIV, Herpes dan Hepatitis B/C sehingga diduga dapat berpotensi mencegah infeksi virus SARS-CoV-2. Dimana pada turunan flavonoid yaitu Quecetrin. Dimana diketahui bahwa senyawa quercetin memiliki kemampuan untuk berikatan dengan Main protein dari SARS-CoV-2, sehingga berpotensi dijadikan inhibitor atau menghambat suatu reaksi dari Main protein dari SARS-CoV-2 sehingga bisa menjadi penghambat daya atau kemampuan dari SARS-COV-2
Link video virtual screening senyawa flavonoid tumbuhan meniran pada SARS-CoV-2 :
Seperti namanya virtual screening, pasti ada beberapa kekurangan atau keterbatasan dalam melalukan pengujian karena pengujian ini dilakukan secara virtual. Apa-apa saja keterbatasan yang ada pada pengujian ini dalam menentukan efektivitas senyawa obat dan bagaimana cara mengatasinya??
ReplyDeletevirtual screening yang saya jelaskan yaitu tentang molecular docking yang bertujuan meniru peristiwa interaksi suatu molekul ligan dengan protein yang menjadi targetnya pada uji in-vitro. Docking membantu dalam mempelajari obat / ligan atau interaksi reseptor / protein dengan mengidentifikasi situs aktif yang cocok pada protein, mendapatkan geometri terbaik dari kompleks ligan – reseptor. keterbatasan dari metode docking ini yaitu sulit optimasi atau mendapatkan hasil yang ideal jika melibatkan banyak derajat kebebasan cara mengatasinya yaitu dengan pendekatan algoritma optimasi untuk mendapatkan senyawa obat secara simulasi
DeleteSeperti yang dijelaskan pada video bahwa pengujian ini dilakukan secara virtual dimana virus Corona yang sudah dikritalisasikan dibuat dalam bentuk virtual tiga dimensi lalu dilakukan screening terhadap senyawa-senyawa tanaman yang bisa mengobati infeksi virus corona secara virtual. Bagaimana efektivitas metode docking molecular ini dalam mengidentifikasi senyawa obat untuk penyakit SARS-COV 2 dibandingkan dengan metode lain seperti in vitro dan in vivo?
ReplyDeleteseperti yang dijelaskan di atas tadi bahwa Molecular docking bertujuan meniru peristiwa interaksi suatu molekul ligan dengan protein yang menjadi targetnya pada uji in-vitro. Docking juga menjadi dasar untuk penemuan obat secara simulasi komputasi. metode docking ini menggunakan struktur 3D protein yang juga sangat penting untuk studi makromolekul lain dengan siapa mereka dapat berinteraksi, sehingga pendekatan docking telah menjadi alat yang sangat penting dan berguna dalam penemuan obat rasional berbasis struktur dan desain
DeleteSeperti yang diketahui bahwa ada beberapa senyawa tanaman obat yang dapat menimbulkan efek samping dalam pengobatan penyakit SARS-COV 2. Bagaimana metode docking molecular dapat mengidentifikasi efek samping dari molekul obat yang dihasilkan?
ReplyDeletemetode docking molekular merupakan metode berbasis genetika yang dapat digunakan untuk mencari pola interaksi yang paling tepat dan melibatkan antara dua molekul, yaitu reseptor dan ligan. sehingga metode ini dasar untuk penemuan obat secara simulasi komputasi, apakah atau senyawa tersebut dapat berikatan atau berinteraksi dengan protein. sehingga untuk mengetahui efek samping yang digunakan dalam pengobatan suatu penyakit harus dilakukan pengujian lagi apabila senyawa tersebut ternyata bisa berikatan dengan protein ligan
DeleteThis comment has been removed by the author.
ReplyDeleteDapat disimpulkan bahwa keterbatasan yang ada pada metode docking molekular ini adalah sulit optimasi atau mendapatkan hasil yang ideal jika melibatkan banyak derajat kebebasan, untuk mengatasinya dilakukan pendekatan algoritma optimasi. Kemudian metode docking molekuler ini bertujuan untuk meniru peristiwa interaksi molekul ligan dan protein yang menjadi targetnya pada uji in vitro. Metode docking ini menggunakan juga menggunakan struktur tiga dimensi pada protein sehingga dapat dilihat interaksi molekul lisan dengan protein. Selanjutnya untuk mengidentifikasi adanya efek samping pada suatu senyawa tanaman obat pada metode docking, harus dilakukan pengujian lagi agar dapat mengetahui efek sampingnya karena metode docking merupakan dasar untuk penemuan obat secara simulasi komputasi.
ReplyDelete